目前，有機(jī)肥無污染處理方法主要有物理方法、化學(xué)方法和生物方法。物理方法，如暴露在陽光下、高溫處理等，化學(xué)方法是使用化合物殺死（不能在有機(jī)食品生產(chǎn)中使用），以及接種細(xì)菌后的堆積、腐爛和堆積。
一、物理方法
1.曝光方法：利用陽光中的紫外線殺滅病毒、寄生蟲、有機(jī)肥猜到的惡臭物質(zhì)，如秸稈肥還田前、堆肥前、畜禽肥爆紅后、沼渣肥使用前、人糞尿使用前等。該方法簡單易行，省工省時(shí)，但營養(yǎng)損失大，容易污染環(huán)境，處理效果差。
2.高溫處理：主要適用于堆肥，利用有機(jī)物分裂釋放能量，提高溫度，殺死肥料中猜測(cè)的病蟲害。高溫堆肥應(yīng)掌握以下技能：
（1）堆肥要求含水量為干材料的60％~75％，用手握住材料時(shí)會(huì)有水滴擠出，表示水分合適。
（2）在堆肥堆放初期，應(yīng)堅(jiān)持良好的通風(fēng)條件，必要時(shí)可設(shè)置通風(fēng)塔、通風(fēng)溝等，后期應(yīng)堅(jiān)持厭氣條件、可拆卸通風(fēng)塔、堵塞通風(fēng)溝等，可卡緊、密封，保持營養(yǎng)，促進(jìn)腐殖質(zhì)積累。
（3）肥料內(nèi)部溫度可控制在50~60℃。當(dāng)溫度高于65℃為了保留氮素，可以翻堆或加水降溫。
（4）要求脫肥材料的碳氮比為25∶1、有利于微生物分裂有機(jī)物。
（5）適合操作pH值。堆肥時(shí)，每500KG秸桿參加1～1.5公斤石灰等堿性物質(zhì)，用于堆肥pH值調(diào)養(yǎng)在7.5擺布。高溫堆肥的衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)是蛔蟲卵死亡率達(dá)到95％~，有效控制蒼蠅繁殖，堆肥周圍沒有活蛆、蛹或新羽化的蒼蠅
二、生物方法
采用生物方法對(duì)有機(jī)肥進(jìn)行無害化處理。什么樣的肥料常用于有機(jī)食品生產(chǎn)。由于使用的微生物不同，有機(jī)肥無害化處理的堆積方法也很多。
1.“301”菌劑漚肥
“301”菌劑具有發(fā)育周期短、繁殖快、易栽培的特點(diǎn)。“301”菌劑能使秸稈在短時(shí)間內(nèi)充分腐熟成秸稈肥，殺滅細(xì)菌、害蟲、草籽，還田后培肥地力，增產(chǎn)效果顯著。堆積腐敗的關(guān)鍵是“喝足，吃飽，蓋嚴(yán)”。喝足了就是秸稈需要充分濕透，充足的水分是纖維素水解的關(guān)鍵。吃飽了就要用足了。“301”菌劑和尿素。堆放時(shí)，將濕秸稈分三層沉積。一、二層各厚50~60厘米，三層厚30~40厘米，撒在每層上部“301”菌劑和尿素的劑量比自下而上為4∶4∶2.嚴(yán)格覆蓋，即沉積完成后，做好泥封工作。如果冬季沉積，堆頂可以覆蓋地膜加熱，或者在堆內(nèi)加入少量驢糞和馬糞，方便前期升溫。
2.催腐劑
堆疊技能方法是“水足，藥均勻，密封嚴(yán)密”水足：按秸稈和水1∶1.7的份額使秸稈濕透，保證了醇厚期的水分要求。均勻用藥:按照濕透秸稈量的0.12％施用催腐劑，用噴霧機(jī)均勻噴灑，邊噴邊攪拌。密封:將噴灑后的秸稈堆放成寬1.5米、高1米的秸稈堆，用土壤和泥漿密封，泥漿厚2厘米。
3.酶菌堆肥
配料是秸稈∶麥麩∶鈣鎂磷肥∶酶菌擴(kuò)大菌∶紅糖∶干雞糞=50∶6∶1∶0.8∶0.1∶20（是材料KG數(shù)，不是百分比）。將麥麩，鈣鎂磷肥，紅糖，酶菌擴(kuò)大菌摻混勻稱后，再和雞糞一同依次撒在用水濕透的秸桿上，拌勻后堆于池中，稍微打壓，每天觀察漚肥溫度，濕度。合適的堆溫為60～65℃，濕度為50％~60％。當(dāng)堆肥呈深棕色腐爛，有光澤，無異味時(shí)，說明酶菌堆肥已完成。
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